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| Foto: CDC |
O Instituto Nacional de Saúde Doutor
Ricardo Jorge sequenciou o genoma do coronavírus SARS-CoV-2 associado aos dois
primeiros casos de Covid-19 detetados em Portugal. A sequenciação do genoma do
novo coronavírus pode revelar-se uma ferramenta importante a vários níveis,
nomeadamente para a ação em saúde pública no contexto de surto, pois, além de
poder sustentar cadeias de transmissão identificadas a nível epidemiológico,
poderá também desvendar novas cadeias, bem como identificar a origem de novas
introduções do vírus em Portugal.
Por outro lado, a sequenciação destes dois casos, ambos
confirmados a 2 de março e estando associados a histórias de viagem a Itália e
a Espanha, vai ainda contribuir para melhorar o conhecimento da variabilidade
genética deste novo vírus à escala mundial, o que permitirá um melhor
desenvolvimento de medidas profiláticas (vacinas) e terapêuticas, na medida em
que os dados gerados pelo Instituto Ricardo Jorge foram imediatamente
partilhados a nível internacional, através da plataforma online Nextstrain e do
repositório GISAID.
As sequências dos dois primeiros casos de Covid-19 em Portugal, que
demoraram cerca de quatros dias a ser obtidas, agruparam com sequências de
outros países, incluindo múltiplos casos associados com história de viagem a
Itália. Para efetuarem a sequência do genoma do novo coronavírus, os
investigadores do Instituto Ricardo Jorge amplificaram laboratorialmente o
material genético do vírus e de seguida a sequência completa do genoma foi
identificada com recurso a tecnologias de sequenciação de nova geração e
análise bioinformática, efetuada através da plataforma online INSaFLU.
A sequenciação destes primeiros casos envolveu profissionais de várias
instituições, incluindo as equipas clínicas dos Hospitais São João e Santo
António do Porto e de laboratórios dos departamentos de Doenças Infeciosas
(DDI) e de Genética Humana do Instituto Ricardo Jorge (Laboratório Nacional de
Referência para a Gripe e outros Vírus Respiratórios, Unidade de Tecnologia e
Inovação e Núcleo de Bioinformática do DDI). O Instituto Ricardo Jorge
sequenciará em breve o genoma do vírus associado a novos casos de Covid-19 em
Portugal.
Desenvolvida pelo Núcleo de Bioinformática e pelo Laboratório Nacional de
Referência para o Vírus da Gripe, sob a coordenação do investigador Vítor
Borges e com o contributo do bioinformático Miguel Pinheiro (Universidade de
Aveiro), a plataforma INSaFLU (“INSide the FLU”) é a primeira plataforma
online, a nível mundial, de livre acesso e de fácil utilização para a
integração da análise total do genoma do vírus influenza na vigilância da
gripe, obedecendo às recomendações das autoridades de Saúde mundiais. Apesar de
ter sido desenvolvida para o estudo da gripe, pode também ser utilizada para o
estudo de outros microrganismos. “Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo
Jorge” - Portugal
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